卷一针道源流针灸直指针灸方宜始论刺热论刺疟论刺咳论刺腰痛论奇病论刺要论刺齐论刺志论长刺节论皮部论经络论骨空论刺水热穴论调经论缪刺论经刺论巨刺论手足阴阳流注论卫气行论诊要经终论刺禁论刺法论五刺应五脏论：
劝读十则
简介自序凡例卷之一卷之二卷之三卷之四卷之五卷之六卷之七卷之八卷之九卷之十卷之十一卷之十二卷之十三卷之十四
凡例卷首前贤医案五脏所司兼五行所属（图缺）动功六字延寿诀太极阴阳动静致病例五轮定位之图八廓定位之图（图缺）五轮歌括五脏主病八廓歌括八廓主病脏腑表里三阴三阳轮廓贯通五运之图六气之图逐年六气总论卷一五轮所
白蒲岭张氏女科广嗣论胎前论产后论妇人月水种子方胎前诸症难产方产后诸症安胎逐月主方补产后总论生化汤论
黄帝内经素问遗篇
摄生总要
一瓢医案
序序刻孙真人眼科秘诀序卷之一孙真人眼科总理七十二症秘诀冲和汤玄灵圣方制炉甘石药开明汤十大将军冲翳散揭障丹十二将军二圣散论二圣散扫雾丹制蕤仁之法大决明散赛宝丹调合赛宝丹法补脑还精丸外治烂弦迎风有泪方卷之
曹序柳序缪序金序顾序自序卷上养身论运气说奇经八脉大旨六脉纲领血营气卫论君臣佐使逆从反正说吐汗下该尽治法论补泻当分缓急有无说推《内经》不宜主旺气说阳有余阴不足论病有真假辨虚损宜分阴阳施治论因病似虚因虚致