脏腑经络先后病脉证治第一湿病脉证第二百合狐惑阴阳毒病证治第三疟病脉证并治第四中风历节病脉证治第五血痹虚劳病脉证治第六肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七奔豚气病脉证治第八胸痹心痛短气病脉证治第九腹满寒疝宿食病
十问合阴阳天下至道谈胎产书杂禁方养生方却谷食气
序卷之上淫热反克之病风热不制之病七情五贼劳役饥饱之病血为邪胜凝而不行之病气为怒伤散而不聚之病血气不分混而遂结之病热积必溃之病阳衰不能抗阴之病阴弱不能配阳之病心火乘金水衰反制之病内急外弛之病奇经客邪之病
序重刻序卷一升降部围药部内消部内护部卷二化毒部点头部拔毒部去腐部止痛部生肌收口部去管部膏药部卷三疔疮部喉症部诸疮部卷四疮部癣疮部痔疮部口牙部鼻耳部脚部补遗
电子版序郑钦安原序张仲景原序（校补）前言凡例伤寒恒论一百一十三方总目一百一十三方总目太阳上篇 计一十四方太阳中篇 计三十五方太阳下篇 计一十四方阳明上篇 计四方阳明中篇 计四方少阳篇 计二方合病篇 计
自序卷之一痈疽门痈疽原委论第一痈疽治法总论第二痈疽阳症歌第三痈疽阴症歌第四痈疽半阴半阳症歌第五痈疽五善歌第六痈疽七恶歌第七治病则例歌第八痈疽灸法并禁灸疮穴第九论病生死法第十察形色顺逆第十一病有三因受病
弁言序题词跋卷一卷二卷三卷四
刘序凡例正面图（图缺）背面图（图缺）指节图灸盏图灸药神方人神在曰不宜灸单十二时人神所在不宜针灸歌十二支曰人神所在不宜针灸歌十干曰人神所在不宜针灸歌尻神图九宫尻神歌应灸七十症中风尸厥偏风眩晕痿症痹症劳伤
太医局诸科程文格
《仁斋直指》序卷之一总论五脏所主论五脏病证虚实论诸阴诸阳论血营气卫论脉病逆顺论男女气血则一论问病论论《易简方论》附∶原脉论（出《保命集》）附论五篇（出《丹溪心法》）附∶十二经脉歌火湿分治论虚实分治论附