序总论（共百字二十句五言）〔附一〕治眼九法〔附二〕茹穹子入道始终入手（一）身法得手进步入手（二）进步数息调息胎息丘真人呼吸歌
序卷上疮科总论五发痈疽论五发痈疽通治方疔疮论瘰论卷下肠痈痔论乳痈论肺痈论诸疳疮论附骨疽论诸疮论疥癣论瘿瘤论疮论便毒论
年序曹序胡序张序姚序目论目议外障外障治法内障内障治法小儿痘毒眼治法小儿疳积眼治法治小儿雀目法附刻薛氏选方
妇科百辩
序自序卷之上脉法脉诀歌金匮解（方附本条）逐月养胎辨并慎择医药论受胎试验法（附方）试男女胎法三禁教养宜忌论饮食七情禁忌论妊娠药忌歌种子补益受胎寿子论胎动安胎论恶阻论胞漏并小产论诸痛论（附孕痈）胎逆上逼胀
电子版序火神立名之本（代序）郑钦安原叙序前言医理真传卷一乾坤大旨坎卦离卦气、血两字作一卦解君、相二火解真龙约言五行总括图三焦部位〔说〕五运所化五行本体受病相传为病论气血盛衰篇辨认一切阳虚证法辨认一切阴
舌鉴辨正
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
自序原病篇卷一·上焦篇风温、温热、温疫、温毒、冬温暑温伏暑湿温、寒湿温疟秋燥补秋燥胜气论卷二·中焦篇风温、温热、温疫、温毒、冬温暑温、伏暑寒湿湿温秋燥卷三·下焦篇风温、温热、温疫、温毒、冬温暑温、伏暑
治法总论用药歌血头行走穴道歌左右论药中禁忌穴名药名全身门第一头面门第二身中门第三脊背门第四腿足门第五金创门第六杖伤附通用门第七跌损妙方书后谨跋