张序卷首保产卷一禀赋脏能脉候胎病胎热胎寒胎肥胎怯胎黄胎惊锁肚不啼不乳脐风撮口噤口变蒸卷二杂症咽喉齿舌口耳目鼻囟颐脐语迟夜啼龟胸龟背鹤节行迟五软五硬卷三痘疮总诀卷四痘疮发热三日诀见点三日诀卷五痘疮起胀三
叙自叙凡例医学集成卷一阴阳诸论天地阴阳人身阴阳病有阴阳药有阴阳阴虚证论阳虚证论先天解说后天解说丹田解说五行生克五脏六腑脏腑表里脏腑所属足六经辨手六经辨十二经络寸关尺解六部脉解脉定至数脉定权衡浮沉统属（
卷一/太阳篇上辨列太阳条例大意太阳正治法第一太阳病脉证三条桂枝汤脉证七条桂枝汤禁三条麻黄汤脉证七条合病证治六条辨伤寒受病阴阳不同一条太阳病愈时日及欲解之候与传经之证六条太阳权变法第二不可发汗例十条桂枝
孙序卷一三吴治验万历龙飞二年吴小峰小川目疾万历甲戌沈中丞案张孝廉后渠大头疫吴江孙行人痛风（有发明）郑都谏公子痘（有发明）张文学子心病虚弱（有发明）大宗伯董浔阳翁脾胃疾（有发明）董龙山夫人便血马厨疟痢并
序论痘疹受病之由论痘疹治法类集痘疹已效名方附方附：
自序序论脏象论经络次序论经络浅深论奇经八脉论总论宗气论营气论卫气论脉诀论病因论中风论八风论轻重论寒热论证候论风脉论治法论药饵附案
原序卷之一一·条令二·检覆总说上三·检覆总说下四·疑难杂说上卷之二五·疑难杂说下六·初检七·覆检八·验尸九·妇人附·小儿尸并胞胎十·四时变动十一·洗罨十二·验未埋瘗尸首十三·验坟内及屋下攒殡尸十四·验
卷上第一章·外疡总论第一节·论阴证阳证第二节·论肿第三节·论痛第四节·论痒第五节·论酸楚不痛第六节·论顽木不痛第七节·论肿疡辨脓之法第八节·论脓之色泽形质第九节·论溃疡之水第十节·论溃疡之血第十一节·
铜人针灸经点校说明卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七
《旧德堂医案》提要《旧德堂医案》序自叙小叙《旧德堂医案》正文